Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms