Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D4W2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms