Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lonrf3Q9D4H7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms