Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rasgef1cQ9D300 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rasgef1cQ9D300 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms