Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Spns3Q9D232 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spns3Q9D232 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms