Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mrpl53Q9D1H8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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