Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3eQ9CZT4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3eQ9CZT4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms