Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rrs1Q9CYH6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rrs1Q9CYH6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms