Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pfdn1Q9CWM4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pfdn1Q9CWM4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pfdn1Q9CWM4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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