Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dis3Q9CSH3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms