Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms