Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nicn1Q9CQM0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nicn1Q9CQM0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms