Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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