Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Nudt21Q9CQF3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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