Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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