Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms