Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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