Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Use1Q9CQ56 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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