Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms