Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim26Q99PN3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim26Q99PN3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms