Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms