Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sf3b1Q99NB9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sf3b1Q99NB9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms