Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms