Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PtprtQ99M80 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PtprtQ99M80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprtQ99M80 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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