Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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