Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms