Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo2Q99LG2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo2Q99LG2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo2Q99LG2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo2Q99LG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnpo2Q99LG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnpo2Q99LG2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms