Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp16Q99LG0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms