Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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