Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rab28Q99KL7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab28Q99KL7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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