Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms