Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tspan1Q99J59 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan1Q99J59 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms