Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfdQ925I7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms