Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf6Q91YR7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms