Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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