Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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