Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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