Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc12Q8R344 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc12Q8R344 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms