Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms