Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rnf183Q8QZS5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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