Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms