Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd3Q8K2F0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms