Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms