Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx8Q8CFD4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms