Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl11Q8CE33 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms