Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms