Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln3Q8C5U9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln3Q8C5U9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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