Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8C5C9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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