Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trub1Q8C0D0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trub1Q8C0D0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trub1Q8C0D0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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