Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ctdsp2Q8BX07 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ctdsp2Q8BX07 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms